Fix interception of subcommand --version flag

Addresses #2286: when subcommand used execute_main_without_stdin and
provided --version flag, cargo intercepted it and printed it's own
version.

Auto merge of #2333 - matklad:remove-unused-var, r=alexcrichton

It became unused after https://github.com/rust-lang/cargo/commit/3194a23a706c17037556c11e7bf4303ea233f208

Is this intentional that unused variables are not denied in tests?

tests: remove unused variable

Auto merge of #2331 - matklad:metadata-encodable-resolve, r=alexcrichton

metadata: change resolve serialization

Auto merge of #2330 - rillian:fixes, r=alexcrichton

std::slice::SliceConcatExt::connect() was deprecated in 1.3.0
and renamed to join(). Now that 1.6.0 is the stable release,
we can transition to the newer method name.

Replace deprecated slice::connect with slice::join.

std::slice::SliceConcatExt::connect() was deprecated in 1.3.0
and renamed to join(). Now that 1.6.0 is the stable release,
we can transition to the newer method name.

Auto merge of #2329 - alexcrichton:fix-nightly, r=alexcrichton

Relax an output assertion to just contains instead of exhaustively matching

Fix a test on nightly Rust

Relax an output assertion to just contains instead of exhaustively matching

Auto merge of #2327 - alexcrichton:ustar-archives, r=alexcrichton

The tar::Builder type by default will build GNU archives, but
unfortunately we force it here to use UStar archives instead. The
UStar format has more limitations on the length of path name that it
can encode, so it's not quite as nice to use.

Older cargos, however, had a bug where GNU archives were interpreted
as UStar archives. This bug means that if we publish a GNU archive
which has fully filled out metadata it'll be corrupt when unpacked by
older cargos.

Hopefully in the future after enough cargos have been running around
with the bugfixed tar-rs library we'll be able to switch this over to
GNU archives, but for now we'll just say that you can't encode paths
in archives that are *too* long.

Closes #2326

Build UStar archives by default

The tar::Builder type by default will build GNU archives, but
unfortunately we force it here to use UStar archives instead. The
UStar format has more limitations on the length of path name that it
can encode, so it's not quite as nice to use.

Older cargos, however, had a bug where GNU archives were interpreted
as UStar archives. This bug means that if we publish a GNU archive
which has fully filled out metadata it'll be corrupt when unpacked by
older cargos.

Hopefully in the future after enough cargos have been running around
with the bugfixed tar-rs library we'll be able to switch this over to
GNU archives, but for now we'll just say that you can't encode paths
in archives that are *too* long.

Closes #2326

Auto merge of #2324 - rillian:fixes, r=alexcrichton

Fix a typo.

Auto merge of #2323 - alexcrichton:update-libgit2, r=alexcrichton

Fixes a linkage error on linux if libhttp_parser is already installed.

Update libgit2-sys

Fixes a linkage error on linux if libhttp_parser is already installed.

Auto merge of #2321 - JanLikar:private-crate, r=alexcrichton

I Accidentally closed #2218, this is the new PR.

[Fix #2202]

 Add field `publish` to Cargo.toml

Field `publish` set to false can be used to prevent a
package from being accidentally published.

Auto merge of #2319 - alexcrichton:compat-12, r=brson

There hasn't actually ever been a request to maintain compatibility with older
stable Rust versions, and it's becoming a bit of a maintenance burden, so just
switch CI to run on stable Rust.

Remove 1.2.0 from .travis.yml

There hasn't actually ever been a request to maintain compatibility with older
stable Rust versions, and it's becoming a bit of a maintenance burden, so just
switch CI to run on stable Rust.

Auto merge of #2317 - alexcrichton:install-current-crate, r=alexcrichton

Rolling together https://github.com/rust-lang/cargo/pull/2205 and  https://github.com/rust-lang/cargo/pull/2240

Auto merge of #2316 - alexcrichton:update, r=alexcrichton

A few small tweaks to tests were necessary to accomodate rust-lang/rust#29520,
and a few changes were made to the code to account for that as well.

Upgrade Rust to build Cargo

A few small tweaks to tests were necessary to accomodate rust-lang/rust#29520,
and a few changes were made to the code to account for that as well.

Be sure the 'is not a crate root' message shows up

Merge branch 'master' of https://github.com/JIghtuse/cargo into install-current-crate

Merge branch 'quick-install' of https://github.com/thirtythreeforty/cargo into install-current-crate

Auto merge of #2196 - matklad:metadata2, r=alexcrichton

Most of the work was done by @dan-t in #1225 and by @winger in #1434

Fixes #2193

I failed to properly rebase previous attempts so I just salvaged this from bits and pieces.

@alexcrichton are you sure that the default format should be TOML? I think that TOML is more suitable for humans, and JSON is better (at the moment at least) for tools. Maybe we should default to ~~TOML~~ JSON?

Auto merge of #2297 - alexcrichton:update, r=alexcrichton

Just a routine for niche bug fixes, linkage errors, perf improvements, etc.

Closes #2295

Update dependencies and Rust version

Just a routine for niche bug fixes, linkage errors, perf improvements, etc.

metadata: use existing infra for JSON output

metadata: add version to format

metadata: simplify

metadata: serialize Resolve

Introduce cargo metadata subcommand

Most of the work was done by @dan-t in #1225 and by @winger in #1434

Fixes #2193

Auto merge of #2081 - vi:cargo_init, r=alexcrichton

Implement `cargo init` command and appropriate tests ( #21).

Features:
* Working like `cargo new` if there are no files in current directory
* Auto-detection of `--bin`
* Auto-detection of already existing VSC and appending to respecive ignore file
* Appending of appropriate `[lib]` or `[[bin]]` section to `Cargo.toml` in case of some non-standard source locations

Concerns:
* I'm not experienced in Rust + lazy => code looks poorer compared to the rest Cargo code
* The test don't cover 100% of functions
* Project consisting of both binary and library is not handled
* Many deviations from [previously proposed algorithm](https://github.com/rust-lang/cargo/pull/2008#issuecomment-145607870)

Implement "cargo init"

When non-existing directory is provided as argument, it
works just like "cargo new".

When existing directory is used, it may also create template
source file like "cargo new" or may find and use existing
source code for Cargo.toml.

Squashed commit of the following:

    cargo init: Supply USER envvar for one test
    cargo init: Other message when Cargo.toml already exists
    cargo init: Resolve conflict after with #2257
    fix minor issues
    cargo new/init: Simplify error handling code in entry points
    cargo new/init: Better message for invalid characters in name
    cargo init: fix minor issues in test
    cargo init: Avoid excessive builds in the test
    cargo init: minor fixes
    cargo init: Skip no_filename test on Windows
    cargo init: Implement better error message for bin name clash
    cargo init: minor fixes
    cargo init: handle "/" path
    cargo init: Actualise
    cargo new: Fix upper case error message in test
    cargo init: Remove paths::{file,directory}_already_exists
    fix uppper-case error messages
    cargo init: Fix minor issues per diff comments
    cargo init: Change binary handling
    cargo init: Move multiple lib error detection away from mk
    cargo init: Support optional path argument
    cargo init: Fix minor issues per Github comments
    cargo init: Fix complaint from tests/check-style.sh
    cargo init: Handle projects with multiple mains
    cargo init: Major refactor, multi-target projects
    cargo init: Add Cargo.lock unconditionally
    cargo init: Fix complains from tests/check-style.sh
    cargo init: Tests for handling VCS
    cargo init: Handle VCS
    cargo init: work in progress
    cargo init: Deduplicate some things between new and init
    cargo init: Auto-detection of --bin
    cargo init: work in progress...
    cargo init: Fix tests and allow explicit --vcs
    cargo init: intermediate refactor
    cargo init: First sketch of implementation
    cargo init: Preliminary test
    cargo init: first stub

See
https://github.com/vi/cargo/tree/cargo_init_unsquashed
for individual commits

Auto merge of #2307 - alexcrichton:readme, r=brson

Running `cargo build` should work just fine to build cargo as well as not
running the python script to download rustc itself. Now that Cargo runs on
stable (and a pretty old stable) most Rust installations should "Just Work" to
build Cargo.

Add more info to README about compiling

Running `cargo build` should work just fine to build cargo as well as not
running the python script to download rustc itself. Now that Cargo runs on
stable (and a pretty old stable) most Rust installations should "Just Work" to
build Cargo.

Merge pull request #2303 from alexcrichton/bump

Bump to 0.9.0

Bump to 0.9.0

Auto merge of #2299 - retep998:staticlib-naming-fiasco, r=alexcrichton

Required for https://github.com/rust-lang/rust/pull/29520

r? @alexcrichton

Support static libraries with names other than libfoo.a
Required for https://github.com/rust-lang/rust/pull/29520

Signed-off-by: Peter Atashian <retep998@gmail.com>

Auto merge of #2296 - alexcrichton:wow-thats-a-bad-bug, r=brson

There was a previous bug where if any crate's name was the start of the crate
being updated that the crate wouldn't resolve at all, and this fixes the prefix
checking error bug.

cc #2293

Auto merge of #2270 - felixc:warn-on-empty-dep, r=alexcrichton

This warns when encountering dependencies of either of these forms:
```
  [dependencies]
  foo = {}
```
and
```
  [dependencies.foo]
```
(with nothing further provided).

In the future, this should likely become a hard error.

Related to #2147

Emit a warning when manifest specifies empty dependency constraints

This warns when encountering dependencies of either of these forms:

  [dependencies]
  foo = {}

and

  [dependencies.foo]

(with nothing further provided).

In the future, this should likely become a hard error.

Auto merge of #2282 - mcarton:clippy, r=alexcrichton

For information, here is the [log before and after](https://gist.github.com/mcarton/684c030321c4c60d6bc9) with Clippy.
Remaining warnings from Clippy are mostly false positive or `str` to `string` conversion (too many of them for this PR).

```
warnings before:
     cmp_owned : 2
     cyclomatic_complexity : 1
     deprecated : 11
     explicit_iter_loop : 57
     identity_op : 3
     len_without_is_empty : 3
     len_zero : 20
     let_and_return : 3
     map_clone : 14
     needless_lifetimes : 4
     needless_return : 24
     ok_expect : 2
     option_map_unwrap_or : 10
     private_in_public : 28
     redundant_closure : 2
     should_implement_trait : 2
     single_match : 3
     str_to_string : 112
     string_to_string : 12
     type_complexity : 3
     unnecessary_mut_passed : 2
     unneeded_field_pattern : 3
     unused_lifetimes : 1
     unused_variables : 2
     while_let_loop : 2

warnings after:
     cmp_owned : 2
     cyclomatic_complexity : 1
     identity_op : 1
     let_and_return : 3
     map_clone : 1
     needless_return : 3
     ok_expect : 2
     option_map_unwrap_or : 1
     private_in_public : 28
     should_implement_trait : 2
     str_to_string : 80
     type_complexity : 3
     while_let_loop : 2
```

Fix update --precise with the registry source

There was a previous bug where if any crate's name was the start of the crate
being updated that the crate wouldn't resolve at all, and this fixes the prefix
checking error bug.

cc #2293

Auto merge of #2285 - sfackler:revert-wildcard-warning, r=alexcrichton

The crates.io change is going through, so we don't want this warning
around after it lands.

r? @alexcrichton

This would perferrably make it into the Cargo that's shipping with 1.6.

Auto merge of #2287 - alexcrichton:openbsd, r=alexcrichton

cc @semarie

Register an OpenBSD snapshot

Drop wildcard crates.io warning

The crates.io change is going through, so we don't want this warning
around after it lands.

Use .cloned() where appropriate

Fix most of Clippy’s map_clone warnings.

Remove some useless String::to_string calls

Fix some Clippy’s string_to_string warnings.

Remove unnecessary mut

Fix all of Clippy’s unnecessary_mut_passed warnings.

Replace single matches by ifs

Fix all Clippy’s single_match warnings.

Remove redundant closure

Fix all Clippy’s redundant_closure warnings.

Use .is_empty() where appropriate

Fix all of Clippy’s len_zero warnings.

Add an is_empty method to types with a len one

Fix all Clippy’s len_without_is_empty warnings.

Remove useless returns

Fix most of Clippy’s needless_return warnings. Remaining cases are
false positives.

Remove useless lifetimes

Fix all Clippy’s needless_lifetimes warnings.

Auto merge of #2281 - rillian:doc-nocapture, r=alexcrichton

Although this is a feature of rustc's test harness and
not cargo's test driver, I can never remember how to
invoke it. Describing the switch in `cargo test --help`
makes it more discoverable.

Document --nocapture to reduce confusion running tests.

Although this is a feature of rustc's test harness and
not cargo's test driver, I can never remember how to
invoke it. Describing the switch in `cargo test --help`
makes it more discoverable.

Auto merge of #2279 - alexcrichton:rerun-if-changed-rust-file, r=brson

There was a failure mode of the handling of the rerun-if-changed directive where
it would rerun the build script twice before hitting a steady state of actually
processing the directives. The order of events that led to this were:

1. A project was built from a clean directory. Cargo recorded a fingerprint
   indicating this (for the build script), but the fingerprint indicated that
   the build script was a normal build script (no manually specified inputs)
   because Cargo had no prior knowledge.
2. A project was then rebuilt from the same directory. Cargo's new fingerprint
   for the build script now indicates that there is a custom list of
   dependencies, but the previous fingerprint indicates there wasn't, so the
   mismatch causes another rebuild.
3. All future rebuilds will agree that there are custom lists both before and
   after, so the directives are processed as one would expect.

This commit does a bit of refactoring in the fingerprint module to fix this
situation. The recorded fingerprint in step (1) is now recorded as a "custom
dependencies are specified" fingerprint if, after the build script is run,
custom dependencies were specified.

Closes #2267

Handle rerun-if-changed directives in dependencies

There was a failure mode of the handling of the rerun-if-changed directive where
it would rerun the build script twice before hitting a steady state of actually
processing the directives. The order of events that led to this were:

1. A project was built from a clean directory. Cargo recorded a fingerprint
   indicating this (for the build script), but the fingerprint indicated that
   the build script was a normal build script (no manually specified inputs)
   because Cargo had no prior knowledge.
2. A project was then rebuilt from the same directory. Cargo's new fingerprint
   for the build script now indicates that there is a custom list of
   dependencies, but the previous fingerprint indicates there wasn't, so the
   mismatch causes another rebuild.
3. All future rebuilds will agree that there are custom lists both before and
   after, so the directives are processed as one would expect.

This commit does a bit of refactoring in the fingerprint module to fix this
situation. The recorded fingerprint in step (1) is now recorded as a "custom
dependencies are specified" fingerprint if, after the build script is run,
custom dependencies were specified.

Closes #2267

Auto merge of #2276 - alexcrichton:fix-nightly, r=alexcrichton

Just some tweaks to compiler error messages

Auto merge of #2228 - tbu-:pr_only_missing, r=alexcrichton

Fix tests on nightly

Auto merge of #2269 - felixc:package-untracked-files, r=alexcrichton

The logic in `sources/path.rs` that finds files that are untracked by the version control system was incorrectly including files that *are* tracked, but had been modified without the modification being committed to Git.

This manifested itself as strange duplications of files (e.g. in `cargo package --list`), since they were listed once as tracked files, and once more as allegedly "untracked" ones. It also caused failures when trying to package the crate when files had been deleted, but the deletion was not yet committed to Git.

Fixes #2199

Fix listing of untracked files to not include tracked but modified ones

The logic in `sources/path.rs` that finds files that are untracked by the
version control system was incorrectly including files that *are* tracked,
but had been modified without the modification being committed to Git.

This manifested itself as strange duplications of files (e.g. in `cargo
package --list`), since they were listed once as tracked files, and once
more as allegedly "untracked" ones. It also caused failures when trying to
package the crate when files had been deleted, but the deletion was not
yet committed to Git.

Fixes #2199

Bump rand to 0.3.13

Auto merge of #2265 - dirk:dirk/include-publish-command-in-help, r=alexcrichton

This is pretty commonly-used command, so I think it merits inclusion in the help text.

Auto merge of #2257 - nrc:lib-template, r=alexcrichton

Only treat missing crate lists as empty

The motivation is that errors other than "file not found" could lead to
the file being overwritten by an empty config, e.g. if the `open` call
is interrupted and returns `EINTR`, then this code would read an empty
config and write it back later on. This can probably happen for other
errors as well (`ENFILE`, ...).

Add publish command to list of commands in help text

Merge pull request #2260 from durka/patch-4

doc/manifest: add `cargo run --example`

Merge pull request #2243 from felixc/zsh-completion-options

Complete the definition of all options for zsh auto-completion

doc/manifest: add `cargo run --example`

Closes #2251. Should it be mentioned anywhere else as well?

Tweak the new project template to be more idiomatic.

Complete the definition of all options for zsh auto-completion

All commands can now auto-complete all of the options they support.

Auto merge of #2237 - sfackler:libc-0.2, r=alexcrichton

Also update everything else which removes all remaining libc 0.1
dependencies

Fix windows

Whitelist improper ctypes to support old rustc versions

Bump libc to 0.2

Also update everything else which removes all remaining libc 0.1
dependencies

Auto merge of #2225 - sgrif:sg-doctest-link-args, r=alexcrichton

It is entirely possible for a crate to have a build script that is simply
the equivalent to

```rustc
fn main() {
    println!("cargo:rustc-link-search=native=/some/path");
}
```

Without actually giving anything to link (for example, because the code
contains `#[link(name="foo")]`. In this case, we aren't actually passing
`-L` through when running doctests, even though they're passed when
compiling the main crate.

Fixes #1592

Remove needless dylib check, add test

In this case the dylib check isn't actually doing anything useful, as
we're just appending search paths. Also adds a test for
8c65284b44337c6cfc003cedc8996e241ac678bd

Auto merge of #2233 - gentoo90:bash-comp, r=alexcrichton

Auto merge of #2235 - felixc:zsh-completion, r=alexcrichton

Adds missing rustc, rustdoc, search, and uninstall subcommands.

Removes obsolete config-for-key and config-list subcommands that don't exist anymore.

Add missing subcommands to zsh auto-completion

Specifically, rustc, rustdoc, search, and uninstall.

Remove obsolete commands from zsh auto-completion

The config-for-key and config-list subcommands don't exist.

Bashcomp: complete --bin, --bench and --test

Auto merge of #2232 - alexcrichton:unused, r=huonw

This includes alexcrichton/toml-rs@39d77b6d which ensures that more unused
fields stick around when decoding TOML, allowing this to:

Closes #2230

Auto merge of #2231 - felixc:docstrings-for-all, r=alexcrichton

Almost all commands have info on what they are for, but a few were
missing it.

Also cleans up some copy/paste misdocumentation along the way.

Update toml dependency to catch more unused keys

This includes alexcrichton/toml-rs@39d77b6d which ensures that more unused
fields stick around when decoding TOML, allowing this to:

Closes #2230

Ensure all subcommands have summary description documentation

Almost all commands have info on what they are for, but a few were
missing it.

Also cleans up some copy/paste misdocumentation along the way.

Auto merge of #2226 - tshepang:unused, r=alexcrichton

Auto merge of #2224 - alexcrichton:rustc-dev, r=brson

This should allow compiling the specified target in the various profiles that
are available to it, e.g. bench or test in addition to the standard
dev.

Closes #2120

Auto merge of #2223 - alexcrichton:better-dev-experience, r=brson

Each test wants to be sure to reset HOME and remove CARGO_HOME from the
environment, but this was done inconsistently throughout the test suite. This
commit consolidates process creation so there's only one point for creating a
process ready to execute the Cargo that's being tested.

Auto merge of #2227 - tbu-:pr_pycache, r=alexcrichton

Running `make` creates the `src/etc/__pycache__` directory which should
not be checked in.

Add __pycache__ to .gitignore

Running `make` creates the `src/etc/__pycache__` directory which should
not be checked in.

remove unused imports

Auto merge of #2219 - matklad:encodable-audit, r=alexcrichton

@alexcrichton another preparation PR for #2196

I've removed obscure `metadata` field from `Target`. It is a breaking change (for read-manifest), but the field seemed cryptic, useless and untested :)

`Target` has a bunch of boolean fields:

```
    tested: bool,
    benched: bool,
    doc: bool,
    doctest: bool,
    harness: bool, // whether to use the test harness (--test)
    for_host: bool,
```

I guess they should not be included in serialized representation?

I will push commits for other `Encodable`s here.